您提到债务纠纷可能超过诉讼时效的问题，根据《民法典》第一百八十八条，诉讼时效期间为三年。若超过此期限，虽非完全无法追讨，但债务人可能因此获得诉讼时效抗辩权，导致法院不支持您的债权请求。因此，建议尽快采取行动，避免时效过期带来的不利影响。
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若债务纠纷协商不成，您可根据《民法典》相关规定，采取以下措施：一是申请仲裁，通过仲裁机构进行裁决；二是向法院起诉，由法院依法审理并作出判决。选择哪种方式，需结合具体情况和证据情况来决定。
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收集债务纠纷证据时，应注意：一是确保证据的真实性和合法性，如合同、借条、转账记录等；二是证据要能够清晰证明债权债务关系，包括金额、期限等；三是尽量收集多种类型的证据，形成完整的证据链，增强证明力。